MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolatopsis orientalis HCCB10007

Total Repeats: 221691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021252	CTGC	2	8	21795	21802	0 %	25 %	25 %	50 %	506928573
502	NC_021252	CGG	2	6	21828	21833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928573
503	NC_021252	AGA	2	6	21920	21925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928573
504	NC_021252	GCG	2	6	21934	21939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928573
505	NC_021252	TTC	2	6	21946	21951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928573
506	NC_021252	TCG	2	6	21983	21988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928573
507	NC_021252	ACG	2	6	22027	22032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928573
508	NC_021252	CG	4	8	22031	22038	0 %	0 %	50 %	50 %	506928573
509	NC_021252	GCG	2	6	22082	22087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928573
510	NC_021252	TCG	2	6	22108	22113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928573
511	NC_021252	CG	3	6	22133	22138	0 %	0 %	50 %	50 %	506928573
512	NC_021252	TTC	2	6	22176	22181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928573
513	NC_021252	CGG	2	6	22226	22231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928574
514	NC_021252	GCG	2	6	22237	22242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928574
515	NC_021252	CGGGCG	2	12	22249	22260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928574
516	NC_021252	GCG	2	6	22270	22275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928574
517	NC_021252	CGG	3	9	22286	22294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928574
518	NC_021252	GCGG	2	8	22302	22309	0 %	0 %	75 %	25 %	506928574
519	NC_021252	GCG	3	9	22327	22335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928574
520	NC_021252	GCT	2	6	22339	22344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928574
521	NC_021252	GCT	2	6	22366	22371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928574
522	NC_021252	GCG	2	6	22378	22383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928574
523	NC_021252	CGG	2	6	22397	22402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928574
524	NC_021252	CGG	2	6	22406	22411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928574
525	NC_021252	CTG	2	6	22412	22417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928574
526	NC_021252	CTG	2	6	22442	22447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928574
527	NC_021252	CGG	2	6	22456	22461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928574
528	NC_021252	CCG	2	6	22507	22512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928574
529	NC_021252	CGA	2	6	22531	22536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928574
530	NC_021252	GCC	2	6	22551	22556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928574
531	NC_021252	CCA	2	6	22570	22575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928574
532	NC_021252	CGC	2	6	22585	22590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928574
533	NC_021252	GCG	2	6	22626	22631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928574
534	NC_021252	CAC	2	6	22667	22672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928574
535	NC_021252	CG	5	10	22709	22718	0 %	0 %	50 %	50 %	506928574
536	NC_021252	TGC	2	6	22719	22724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928574
537	NC_021252	CGA	2	6	22783	22788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928574
538	NC_021252	AGT	2	6	22792	22797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928574
539	NC_021252	TCG	2	6	22801	22806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928574
540	NC_021252	CAT	2	6	22808	22813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928574
541	NC_021252	GCG	2	6	22842	22847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928574
542	NC_021252	CGCTG	2	10	22882	22891	0 %	20 %	40 %	40 %	506928574
543	NC_021252	TCT	2	6	23018	23023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928575
544	NC_021252	TCG	2	6	23035	23040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928575
545	NC_021252	GCT	2	6	23045	23050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928575
546	NC_021252	GGC	2	6	23051	23056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928575
547	NC_021252	GCC	3	9	23075	23083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928575
548	NC_021252	CCCG	2	8	23129	23136	0 %	0 %	25 %	75 %	506928575
549	NC_021252	GCCCGT	2	12	23158	23169	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	506928575
550	NC_021252	TCT	2	6	23257	23262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928575
551	NC_021252	CCG	2	6	23314	23319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928575
552	NC_021252	TGG	2	6	23332	23337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928575
553	NC_021252	GGC	2	6	23342	23347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928575
554	NC_021252	CGA	2	6	23372	23377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928575
555	NC_021252	CGG	2	6	23380	23385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928575
556	NC_021252	GGC	2	6	23394	23399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928575
557	NC_021252	ACC	2	6	23463	23468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928575
558	NC_021252	AGG	2	6	23506	23511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928575
559	NC_021252	CGG	2	6	23748	23753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928576
560	NC_021252	TCG	2	6	23775	23780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928576
561	NC_021252	GCG	2	6	23802	23807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928576
562	NC_021252	CGT	2	6	23818	23823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928576
563	NC_021252	CGC	2	6	23836	23841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928576
564	NC_021252	AAG	2	6	23846	23851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928576
565	NC_021252	CAT	2	6	23863	23868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928576
566	NC_021252	CGC	2	6	23872	23877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928576
567	NC_021252	CGA	2	6	23893	23898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928576
568	NC_021252	GGC	2	6	23945	23950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928576
569	NC_021252	CGA	2	6	23983	23988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928576
570	NC_021252	CG	3	6	24021	24026	0 %	0 %	50 %	50 %	506928576
571	NC_021252	AGC	2	6	24035	24040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928576
572	NC_021252	AAG	2	6	24053	24058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928576
573	NC_021252	AAG	2	6	24086	24091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928576
574	NC_021252	GAG	2	6	24098	24103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928576
575	NC_021252	CCG	2	6	24284	24289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928577
576	NC_021252	TCG	2	6	24292	24297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928577
577	NC_021252	CCGG	2	8	24306	24313	0 %	0 %	50 %	50 %	506928577
578	NC_021252	CCT	2	6	24320	24325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928577
579	NC_021252	CCA	2	6	24359	24364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928577
580	NC_021252	GTC	2	6	24384	24389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928577
581	NC_021252	CCG	2	6	24411	24416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928577
582	NC_021252	GCG	2	6	24528	24533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928577
583	NC_021252	CGG	2	6	24563	24568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928577
584	NC_021252	CGT	2	6	24575	24580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928577
585	NC_021252	CCT	2	6	24611	24616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928577
586	NC_021252	CGG	2	6	24698	24703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928577
587	NC_021252	CTG	2	6	24775	24780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928577
588	NC_021252	CACGG	2	10	24916	24925	20 %	0 %	40 %	40 %	506928578
589	NC_021252	GAA	2	6	24930	24935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928578
590	NC_021252	ACG	2	6	24965	24970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928578
591	NC_021252	CTG	2	6	24973	24978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928578
592	NC_021252	CGA	2	6	24984	24989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928578
593	NC_021252	TCG	2	6	25004	25009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928578
594	NC_021252	CCCG	2	8	25085	25092	0 %	0 %	25 %	75 %	506928578
595	NC_021252	CG	3	6	25113	25118	0 %	0 %	50 %	50 %	506928578
596	NC_021252	GGC	2	6	25140	25145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928578
597	NC_021252	CGC	2	6	25158	25163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928578
598	NC_021252	CTT	2	6	25218	25223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928578
599	NC_021252	TTC	2	6	25371	25376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928579
600	NC_021252	CGG	2	6	25381	25386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928579
601	NC_021252	TTC	2	6	25413	25418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928579
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603	NC_021252	GCGGCC	2	12	25503	25514	0 %	0 %	50 %	50 %	506928579
604	NC_021252	GCG	2	6	25518	25523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928579
605	NC_021252	GAG	2	6	25534	25539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928579
606	NC_021252	CGGG	2	8	25540	25547	0 %	0 %	75 %	25 %	506928579
607	NC_021252	GCGG	2	8	25548	25555	0 %	0 %	75 %	25 %	506928579
608	NC_021252	CGG	2	6	25562	25567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928579
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610	NC_021252	GGC	2	6	25610	25615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928579
611	NC_021252	CGA	2	6	25624	25629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928579
612	NC_021252	CGA	2	6	25656	25661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928579
613	NC_021252	CGG	2	6	25681	25686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928579
614	NC_021252	CTT	2	6	25718	25723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928579
615	NC_021252	CGC	2	6	25724	25729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928579
616	NC_021252	CTT	2	6	25739	25744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928579
617	NC_021252	CGG	2	6	25765	25770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928579
618	NC_021252	GGC	2	6	25787	25792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928579
619	NC_021252	CCT	2	6	25843	25848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928579
620	NC_021252	GCC	2	6	25854	25859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928579
621	NC_021252	TCT	2	6	25897	25902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928579
622	NC_021252	CTT	2	6	25910	25915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928579
623	NC_021252	GC	4	8	25916	25923	0 %	0 %	50 %	50 %	506928579
624	NC_021252	GC	3	6	26038	26043	0 %	0 %	50 %	50 %	506928579
625	NC_021252	TGG	2	6	26211	26216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928580
626	NC_021252	ACCA	2	8	26239	26246	50 %	0 %	0 %	50 %	506928580
627	NC_021252	AACCTG	2	12	26257	26268	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	506928580
628	NC_021252	TCG	2	6	26303	26308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928580
629	NC_021252	ACG	2	6	26375	26380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928580
630	NC_021252	TGC	2	6	26414	26419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928580
631	NC_021252	GCG	2	6	26423	26428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928580
632	NC_021252	ACCGGC	2	12	26434	26445	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	506928580
633	NC_021252	CGG	2	6	26448	26453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928580
634	NC_021252	CGA	2	6	26472	26477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928580
635	NC_021252	CTG	2	6	26512	26517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928580
636	NC_021252	TTC	2	6	26557	26562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928580
637	NC_021252	CGA	2	6	26576	26581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928580
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639	NC_021252	CGG	2	6	26675	26680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928580
640	NC_021252	ACC	2	6	26782	26787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928581
641	NC_021252	CAG	2	6	26801	26806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928581
642	NC_021252	GCC	2	6	26807	26812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928581
643	NC_021252	TGG	2	6	26825	26830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928581
644	NC_021252	GCC	2	6	26903	26908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928581
645	NC_021252	GGCC	2	8	26938	26945	0 %	0 %	50 %	50 %	506928581
646	NC_021252	CAG	2	6	26948	26953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928581
647	NC_021252	CAG	2	6	26963	26968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928581
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649	NC_021252	TCC	2	6	27048	27053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928581
650	NC_021252	TCT	2	6	27072	27077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928581
651	NC_021252	TCA	2	6	27078	27083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928581
652	NC_021252	AAC	3	9	27110	27118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	506928581
653	NC_021252	GGCG	2	8	27166	27173	0 %	0 %	75 %	25 %	506928581
654	NC_021252	TGG	2	6	27179	27184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928581
655	NC_021252	CTG	2	6	27218	27223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928581
656	NC_021252	TCG	2	6	27255	27260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928581
657	NC_021252	GCC	2	6	27261	27266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928581
658	NC_021252	GCT	2	6	27319	27324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928581
659	NC_021252	CGG	2	6	27325	27330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928581
660	NC_021252	GGT	2	6	27373	27378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928581
661	NC_021252	GTCATC	2	12	27422	27433	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	506928581
662	NC_021252	GCT	2	6	27457	27462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928581
663	NC_021252	TCA	2	6	27486	27491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928581
664	NC_021252	CGG	2	6	27529	27534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928581
665	NC_021252	TCG	2	6	27537	27542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928581
666	NC_021252	ACC	2	6	27554	27559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928581
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682	NC_021252	CGG	2	6	28117	28122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928582
683	NC_021252	TGG	2	6	28123	28128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928582
684	NC_021252	CGT	2	6	28184	28189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928582
685	NC_021252	CGC	2	6	28246	28251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928582
686	NC_021252	CGGCC	2	10	28259	28268	0 %	0 %	40 %	60 %	506928582
687	NC_021252	ACT	2	6	28306	28311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928582
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691	NC_021252	AGCCGG	2	12	28461	28472	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	506928583
692	NC_021252	AGT	2	6	28518	28523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928583
693	NC_021252	CCG	2	6	28524	28529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928583
694	NC_021252	GCC	2	6	28536	28541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928583
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696	NC_021252	GCC	2	6	28616	28621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928583
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699	NC_021252	CAG	2	6	28658	28663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928583
700	NC_021252	CACCGC	2	12	28807	28818	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	506928584
701	NC_021252	AGC	2	6	28828	28833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928584
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704	NC_021252	TCGG	2	8	29023	29030	0 %	25 %	50 %	25 %	506928584
705	NC_021252	TCT	2	6	29045	29050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928584
706	NC_021252	TGG	2	6	29102	29107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928584
707	NC_021252	GCC	3	9	29490	29498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928585
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713	NC_021252	GCG	2	6	29588	29593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928585
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723	NC_021252	ATC	3	9	29986	29994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928585
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730	NC_021252	GCC	2	6	30152	30157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928585
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737	NC_021252	CGG	2	6	30439	30444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928586
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740	NC_021252	TGC	2	6	30600	30605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928587
741	NC_021252	CGGT	2	8	30608	30615	0 %	25 %	50 %	25 %	506928587
742	NC_021252	CGC	2	6	30619	30624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928587
743	NC_021252	CGA	2	6	30649	30654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928587
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745	NC_021252	CGC	2	6	30715	30720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928587
746	NC_021252	GCT	2	6	30814	30819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928587
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748	NC_021252	GAG	2	6	30926	30931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928587
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750	NC_021252	CGC	2	6	31087	31092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928587
751	NC_021252	TGC	2	6	31110	31115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928587
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872	NC_021252	CGC	2	6	35840	35845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928592
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1000	NC_021252	TGA	2	6	41646	41651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928598

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